有人認為在減肥時用魚來取代肉類補充蛋白質是比較好的選擇。原因是魚的脂肪含量相對較低，但也要注意，魚的熱量有時也比想像中高。

在魚類中，油脂較多的鯖魚和沙丁魚的熱量比想像中還要高。根據食品藥品安全處的食品營養成分資料庫，以一塊魚肉（100克）為基準，鯖魚為246千卡，沙丁魚為232千卡，鱈魚為149千卡，鮪魚為132千卡，鰯魚為127千卡，鮭魚為106千卡，秋刀魚為107千卡，大黃魚為86千卡，鳕魚為80千卡，烏頭魚為63千卡。若加上調味或油炸食用，熱量會更高。

肉類的熱量以每100克為基準，水煮雞肉142大卡，炸雞肉289大卡，豬里肌肉204大卡，五花肉484大卡，牛里肌肉357大卡，牛肋排312大卡。減肥時，比起吃鯛魚或鯖魚，吃雞肉可能更好。

儘管如此，魚類之所以被視為健康食品，是因為其脂肪的組成。

魚類比肉類含有更多的不飽和脂肪。鮪魚的DHA（Omega-3脂肪酸的一種）含量高達34.6%。三文魚（16.1%）和鯖魚（11%）也富含DHA。DHA有助於血管健康，防止眼睛乾澀。據悉，DHA與大腦細胞發展相關，有助於提升記憶力和學習能力。

食用魚類時，應注意內分泌干擾物質多氯聯苯。

根據食品藥品安全處的資料，2012年至2017年間，各類食品的多氯聯苯平均污染程度依序為：水產、畜產品、加工食品、農產品。

在海產中，檢出率最高的是鯨魚、鱸魚、烏賊、鯡魚、螺和道魯木。

多氯聯苯容易在魚的魚皮或內臟中積聚，因此建議在烹調前將其去除。煮熟也是一個方法。據說，煮熟後再烹調比烤制時能更有效降低食品中的多氯聯苯含量。